论文查重率不合格的原因分析主要包括以下几个方面：一是抄袭现象严重，学术不端行为导致查重率高；二是引用不规范，未正确标注引用来源；三是语言表达不够独特，容易与他人论文雷同。针对这些问题，作者应加强学术道德意识，规范引用格式，保证引用准确性和完整性，同时提高论文原创性和独特性，避免与他人雷同，从而提高查重率。

另外，论文查重率不合格的原因还可能与文献综述不够充分、数据分析不够深入、结构安排不合理等因素有关。为了提高论文质量，作者应当加强文献综述工作，深入挖掘相关研究，做到全面收集和理解文献资料；在数据分析阶段，要细致入微地处理数据，避免数据处理不当导致查重率不合格；此外，论文结构安排也至关重要，要合理布局，层次清晰，逻辑严谨，确保论文内容完整、连贯，从而提高查重率。