期刊论文查重率合格标准的制定原则是多方面的。首先，要考虑到学术诚信的重要性，避免抄袭和剽窃他人作品。其次，要注重原创性和独立性，确保论文内容真实可靠。另外，还需要考虑到学术规范和标准，遵循学术界的规则和要求。总的来说，期刊论文查重率合格标准的制定原则应该是科学、严谨、公正、公平的。

在制定期刊论文查重率合格标准时，需要考虑到多方面因素。首先，要明确规定论文查重率的标准和要求，确保论文的原创性和独立性。其次，要建立完善的查重机制，及时发现和处理抄袭行为。此外，还需要加强学术道德教育，提高学者的学术水平和诚信意识。综上所述，期刊论文查重率合格标准的制定原则应该是科学、合理、公正、公平的，有利于促进学术交流和发展。